1949 yılında, bugün Slovenyanın başkenti olan Ljubljanada doğdu. Zizek, bir sosyal bilimci olarak kendisine kurduğu matriksi bu coğrafyaya borçludur. Üniversite eğitimine sosyoloji ve felsefe alanında başladı. Yüksek lisansını (1975) felsefe alanında, doktora derecesini de (1981) yine felsefe alanında Ljubljana Sanat Fakültesi Felsefe Bölümünde tamamladı. İkinci doktorasınıysa Paris VIII Üniversitesinde psikanaliz alanında 1985 yılında tamamladı. Bu dönemde Jacques Lacanın asistanı olan Jacques Alain Miller ile çalıştı. 1970lerin ilk yarısında düşüncelerini şekillendiren Fransız düşünürler Lacan, Derrida ve Foucault oldu. 1970lerde Slovenyada Kuramsal Psikanaliz Derneğini kurdu.